本发明公开了一种阀门减速机主轴驱动对接结构，包括旋转驱动模块，旋转驱动模块的输出轴上通过万向连接机构连接有第一棱柱体，第一棱柱体上滑动套设有与其相配合的调节筒体，调节筒体的长度长于第一棱柱体的长度，调节筒体的内部且位于第一棱柱体的下方滑动插设有与其相配合的第二棱柱体，第二棱柱体的下端部伸出调节筒体，第二棱柱体的下端部滑动套设有与其相配合的套筒，套筒的上部内孔与第二棱柱体相配合，套筒的下部内孔的横截面形状与阀门减速机的中心轴的端头形状相一致。本发明不仅能够实现阀门减速机主轴的自动旋转以提高作业效率，而且能够减少对阀门减速机主轴的冲击，同时还能够适用于不同阀门井深度内的阀门减速机。