本发明公开了一种自动上下料式的吸管灭菌生产线，包括有灭菌箱，灭菌箱内架设有循环输送带，灭菌箱进料端架设有进料工作台，进料工作台的进料端架设有用于放置吸管周转箱的底座，进料工作台的外端部安装有用于推料的推板，进料工作台的一侧设有吸管托盘放置架，吸管托盘放置架放置有吸管托盘，灭菌箱出料端架设有接料台，接料台上分布有间隔设置的输送辊，接料台的一侧设有接料架，接料台的另一侧设有推料板二，接料架的一端架设有推料板三，接料架的另一端架设有接料机构。本发明可实现吸管在灭菌箱内进行生产线式流动式杀菌的过程，杀菌效果好，同时还具有自动上料和下料以及对杀菌后的吸管进行及时的收装处理，避免投料过程中会产生细菌。