本发明涉及一种双作用柱塞泵性能测试方法及系统，包括：S1、设置一位移监测点，在位移监测点监测柱塞泵中柱塞在运动过程中的相对位移监测点的实时位移量；S2、根据实时位移量生成柱塞的运动过程中柱塞的位移波形，并标识位移波形中柱塞的极限位置；S3、根据位移波形获取与柱塞的运动过程对应的第一运动持续时间，以及在第一运动持续时间内的柱塞的起始位置、柱塞的结束位置和起始位置与结束位置之间极限位置次数；S4、根据起始位置、结束位置以及极限位置次数获取柱塞的与第一运动持续时间对应的工作位移；S5、获取柱塞的横截面积，以根据工作位移和横截面积获取柱塞泵的注入流量。实施本发明使得柱塞性能测试过程简单，测试精度高。