本发明提供了一种充填钻孔施工出水治水方法，通过设计封孔、透孔、高压灌浆、充填套管定位设置和扫孔的充填钻孔治水方案，在充填套管的下端设置逆止装置；将充填套管轴向自下向上定位放入透孔位置的钻孔内，使逆止装置设在水泥层的底端；再根据空隙体积配置水泥浆并灌入充填套管内，再通过向充填套管内强灌入清水，使水泥浆通过逆止装置从充填套管向水泥层溢流，直到充填套管外壁与钻孔之间的环状间隙返出水泥浆时停泵，等待凝固48小时后撤泵，从而实现充填套管外壁与钻孔之间的环状间隙全部被高强水泥封住；从而确保充填管道止水且能长时间安全工作，从而保证充填系统能按时、正常、调试与运行，可解决环状间歇泄水问题，设计合理，经济实用。