本发明提供了一种拉冬变换多次波压制方法及系统，属于地球物理勘探技术以及计算机领域。所述方法对动校正之后的共中心点道集进行高分辨拉东变换和自适应相减得到经过多次波压制后的共中心点道集数据。所述方法包括：S1，输入原始共中心点道集；S2，消除原始共中心点道集中的缺失道，得到补足的共中心点道集数据；S3对所述补足的共中心点道集数据进行动校正，得到动校正后的共中心点道集数据；S4，采用MapReduce框架对所述动校正后的共中心点道集数据进行处理获得经过多次波压制后的共中心点道集数据。本发明避免了对数据预处理的高要求，实现了高精度去除多次波的效果，提高了数据管理性能以及海量数据处理能力。