本发明提供了一种用于燃料电池发动机的气液分离装置，包括箱体、气液混合物入口、出水口、排气口和人字形隔板，所述人字形隔板固定安装在箱体内，人字形隔板的左右两侧分别与箱体形成第一腔体和第二腔体，人字形隔板的下侧与箱体形成第三腔体，第一腔体和第二腔体连通，第二腔体和第三腔体连通，气液混合物入口设置在箱体上且与第一腔体连通，出水口设置在箱体底部且与第三腔体连通，排气口设置在箱体顶部侧方且与第二腔体连通。这种用于燃料电池发动机的气液分离装置的优点在于：结构简单，重量轻，可靠性强；制作简单，成本较低，易于成型；无需使用滤网或滤芯，水箱内流阻较小，内部腔体压力分配合理。