本发明公开了一种降低柴油中多环芳烃的催化剂级配工艺，包括如下内容：在加氢反应条件下，柴油原料由上至下依次通过固定床反应器内的第一催化剂床层和第二催化剂床层，与各床层的催化剂及自下而上的氢气进行加氢反应，加氢反应产物由反应器底部流出；其中第一催化剂床层装填第一加氢催化剂，该催化剂包括加氢催化剂载体和加氢活性组分；第二催化剂床层装填第二加氢催化剂，该催化剂包括氧化铝载体和活性金属组分，其中活性组分为金属态Pt和/或Pd，氧化态NiO和/或CoO；以催化剂的重量为基准，Pt和/或Pd活性组分为0.3wt%‑8.0wt%，NiO和/或CoO为1wt%‑10wt%。该工艺通过催化剂和工艺流程的配合能够在流程简单、低能耗、低成本的条件下，能够有效降低柴油原料中的多环芳烃含量，生产高品质柴油。