本发明涉及一种热塑性聚氨酯弹性体纳米复合材料及制备方法，属于改性聚氨酯复合材料领域，解决了现有技术中改善TPUE强度、耐磨性能的同时无法保持TPUE的韧性的问题。本发明公开的热塑性聚氨酯弹性体纳米复合材料，原料包括在热塑性聚氨酯弹性体的聚合过程中引入的反应型纳米二氧化硅，其中反应型纳米二氧化硅是表面含有具有反应能力的活性氨基官能团的氨基纳米二氧化硅纳米粒子。该材料是通用的高分子材料，可在鞋材、电缆、汽车、管材、薄膜领域广泛应用。