一种适用于双向泵站的新型双级柔性拍门装置及其运行方法，包括中心轴、导流板、双级拍门、大型弹簧、磁力板和水泵顶盖。双级柔性拍门装置为可拆卸结构，每一级拍门由2个单独的拍门构成，单个拍门的外侧采用1/4圆曲面造型，设置在所述出水喇叭口的正上方，活动连接于中心轴且可绕中心轴进行螺旋移动且二级拍门的重量大于一级拍门，单个拍门中和水泵顶盖中均设有磁板层，单个拍门和拍门顶盖之间斜向布置大型弹簧。整个装置通过拍门自重、弹簧弹力（拉力）、磁板吸引力以及水压力之间的平衡关系实现分级出流和分级断流。本发明结构简单，构思新颖，能保证开机时拍门能够被顺利、及时的打开且水流能保持良好的流态，关机时拍门利用重力及时关闭。