本发明公开了一种焦化石脑油加氢精制方法，包括以下内容：将焦化石脑油和氢气并流进入加氢反应器，与催化剂进行反应；所述的加氢反应器内沿物料流动方向依次设置一个加氢脱硅催化剂床层和n个加氢精制催化剂床层，其中n≥2；所述n个加氢精制催化剂床层沿物料流动方向依次为第一加氢精制催化剂床层、第二加氢精制催化剂床层、……第N加氢精制催化剂床层；加氢脱硅催化剂床层占总催化剂床层体积的10%~50%；n个加氢精制催化剂床层中的催化剂活性金属由第一~第N逐层增加，该方法针对焦化石脑油中杂质硅的脱除和烯烃加氢饱和工艺过程，采用加氢脱硅剂和加氢精制催化剂组合分段级配，调整进氢方式，提高了催化剂床层的抗积炭和脱硅能力。