本发明适用于生物检测技术领域，提供了一种捕获和/或计数细胞的微流控芯片及其制备方法和应用，该微流控芯片包括：第一基层；抗体修饰的反蛋白石光子晶体结构，设置在第一基层上，其包括抗体修饰层以及掺杂有Yb³⁺和Er³⁺的钒酸钇反蛋白石结构层；第二基层，设置在第一基层靠近抗体修饰的反蛋白石光子晶体结构的一侧；微流控腔，设置在第一基层与第二基层之间。本发明通过调控光子晶体最小重复单元尺寸控制光子带隙，制作双层不同孔径、不同带隙的掺杂有Yb³⁺和Er³⁺的钒酸钇的反蛋白石结构，可以通过光子晶体的带隙效应，使上转换绿光发射获得明显增强的效果，解决了现有上转换发光过程的低量子效率导致的荧光强度不足的问题。