本申请涉及新能源技术领域，具体涉及一种燃料电池短堆模组、燃料电池电堆以及电堆组装方法，燃料电池短堆模组包括短堆组件，短堆组件包括多个间隔堆叠的电极板以及膜电极，短堆组件具有电化学反应所需的反应物流通的多个流通通道；以及壳体，短堆组件安装于壳体内部，壳体顶部设有第一对接部，底部设有与第一对接部配合的第二对接部，第一对接部具有导电结构以及连接通道，导电结构与短堆组件电性连接，连接通道与流通通道对接。本申请通过壳体安装短堆组件，形成预先组装的燃料电池短堆模组，然后再将燃料电池短堆模组进行叠加组装导通电性连接以及流通通道，即可得到燃料电池电堆，提高了燃料电池电堆的组装效率，保证电堆的一致性与稳定性。