本发明涉及一种深海低噪声变量泵，包括泵体，所述泵体包括间距设置的缸体、从缸体上向间距处延伸出的第一封闭板、位于缸体和第一封闭板之间的堵头、密封连接在两侧第一封闭板之间的柱塞座，缸体、第一封闭板、堵头和柱塞座形成用于容纳油液的油腔；所述缸体的内端面上开设柱塞孔，柱塞孔连通有低压进口，缸体的外端面设有高压出口；所述柱塞孔内设置永磁柱塞，在缸体内端面靠近永磁柱塞处开槽，槽内设置旋转线圈，柱塞座上设置推力线圈；能够通过控制永磁柱塞的运动速度，达到改变柱塞泵排量的目的，也能够通过调节柱塞孔和柱塞的距离，改变柱塞单次运动的行程，以改变柱塞泵的排量。