本发明公开了一种病源样本采集装置，其技术方案要点是包括有送样软管、真空收样管，真空收样管上设置有密封穿刺组件，包括进样筒、送样筒、密封膜、能够在送样筒与进样筒螺紧过程中穿刺密封膜并进入真空收样管内的针管，送样软管上设置有密封阻流组件，包括有出样阀体、球阀、进样阀体，进样阀体与出样阀体的抵接面上设置有能够切割球阀并封堵的切割组件。本发明能够利用密封穿刺结构将针管插入到真空收样管中实现病源液的收集，利用密封阻流结构切断病源液的流通，再对球阀进行切割分离，实现了病源液的安全收集，同时分离后的球阀能够继续作为真空收样管内病源液流通的开关，不需要采用额外的注射器对病源液进行抽取，方便了病源液的取出。