公开了一种数据处理方法和系统。该方法包括：获取合作方对数据x的一部分和数据y的一部分进行加密的加密结果；将获取的加密结果分别与获取的数据x的另一部分和数据y的另一部分进行组合；生成经打乱顺序的组合结果各自与随机数进行运算的运算结果，作为扰动结果；以及将扰动结果发送给合作方，用于合作方对扰动结果的解密。随后，双方角色互换，进行二次随机排序。己方和合作方的加密为同态加密，针对数据的分割和运算符合秘密共享分割和运算规则，由此二次扰动后得到双方都不知晓数据顺序但仍持有秘密共享形式的经处理数据。