本发明涉及一种真空自耗熔炼合金的方法，包括如下步骤：提供含有正偏析元素合金铸；将合金铸锭经电极压制、焊接，并进行真空自耗熔炼，得到一次铸锭；将一次铸锭沿径向自心部切分为至少3个子铸锭，再将各子铸锭的边部朝内首尾拼装以形成中空结构，各子铸锭的头部均在中空结构的第一端，各子铸锭的底部均在中空结构的第二端；将反偏析芯棒设于中空结构的中空内，得到d反偏析芯棒中各元素的种类与合金铸锭中相同，同种正偏析元素在反偏析芯棒中的重量含量低于合金铸锭；将中间自耗电极进行真空自耗熔炼，在中间自耗电极进行第一次真空自耗熔炼的步骤中第一端向下设置，第二端向上设置。该方法能够有效抑制正偏析元素的偏析。