本申请提供一种飞行器驾驶舱乘员碰撞防护系统、方法，其中，碰撞防护系包括气囊模块组件、信号采集系统、信号处理系统和控制系统；信号采集系统，用于采集飞机处于预设状态的飞行信息和乘员状态信息；信号处理系统用于将飞行信息与乘员状态信息与预设飞机失效碰撞信号模式进行比对分析，以判断飞机是否处于以异常状态并生成异常分析结果；控制系统用于根据异常分析结果启动气囊模块组件和用于当启动气囊模块组件失效时，并根据手动操作指令启动气囊模块组件。本申请能够实现系统自动判别功能，同时在自动判别功能失效时，能够在响应驾驶舱乘员的手动操作指令，从而更全面、更可靠、更智能保障驾驶舱乘员的生命安全。