本发明公开了一种用于萘加氢制备十氢萘的催化剂的制备方法及其使用方法。该发明利用不完全脱除模板剂的硅基介孔分子筛来限域合成低温下具有超高加氢脱芳活性的催化剂。其主要创新点在于合成以含氮元素的表面活性剂为模板剂的硅基介孔分子筛，对模板剂进行不完全脱除(碳化)处理，即空气中低温碳化或氮气中高温碳化，利用残留的碳物种实现对金属组分的分离固定，防止金属组分在后续高温处理中的颗粒烧结，从而实现对超小金属纳米粒子簇的限域合成。另外碳化后的模板剂可分解重组为一种氮掺杂的碳材料，其在助催化和富集反应物方面表现优异。该催化剂制备方法简单环保，在萘加氢制备十氢萘的反应中有很高的活性和十氢萘选择性。