本发明提供一种数字免疫芯片及其制备方法，属于免疫检测芯片技术领域，其可解决现有的免疫物质检测方法中试剂消耗量多，通量低的问题。本发明的一种数字免疫芯片，包括相对键合设置的第一基板和第二基板；所述第一基板包括：第一基底、设置在所述第一基底上的驱动电极；设置在所述驱动电极所在层背离所述第一基底一侧的第一疏水层；以及设置在所述驱动电极与所述第一疏水层之间的介电层；所述第二基板包括：第二基底，设置于所述第二基底上的免疫检测物；所述免疫检测物设置于所述第二基板靠近所述第一基板的一侧表面；所述免疫检测物包括抗原或者抗体。