本发明属于化工生产设备技术领域，具体为一种冷却器自动清扫装置及其清扫控制方法。其应用于负压蒸氨设备中，用于对不凝气冷却器进行自动清扫，不凝气冷却器采用列管式换热器，列管式换热器的壳程与氨气管道连通，列管式换热器的管程与冷却水连通；该装置包括：至少一个增加的列管式换热器、至少四个换热器管程用电磁阀、至少两个换热器壳程用电磁阀、至少四个压力传感器、至少四个温度传感器，以及PLC控制器。该装置可以有效解决负压蒸氨设备中不凝气冷却器的堵塞问题，并进行不停机地自动清扫，清扫效率高，可以有效提高负压蒸氨工艺的效率。