本发明公开了一种抗污染改性聚氯乙烯复合膜及其制备方法，所述复合膜包括第一功能层、中心微粒和第二功能层，所述第一功能层位于第二功能层的上方，所述中心微粒位于第一功能层和第二功能层之间，所述第一功能层、中心微粒和第二功能层的平均孔径逐渐降低。本发明通过对复合膜结构的设置，由上至下形成平均孔径逐渐降低的第一功能层、中心微粒和第二功能层叠结构，且第一功能层为由上至下孔径渐降的不对称膜层，制得双重不对称结构，缓解水处理时水系带来的负压，避免蛋白质等有机物质随水流进入孔隙，流转到复合膜的下表面，且平均孔径减窄的孔隙易于将蛋白质等有机物质去除，更利于复合膜防污染性能的实现。