本发明公开一种重大交通事故预警方法、系统及存储介质，属于交通安全技术领域。重大交通事故定义为有亡人的交通事故，现有技术中没有关于重大交通事故的未来发生时间点的研究，本发明提供一种重大交通事故预警方法，数据获取模块获取交通事故原始样本数据和交通违法原始样本数据，数据处理模块根据数据获取模块获取的数据根据道路属性计算重大交通事故发生前的累计违法次数，并使用核密度估计计算重大交通事故发生之前累计违法数据的估计值，数据预测模块将计算所得估计值作为预警阈值进行预警，可靠预测重大交通事故的发生时间区间，提高道路交通的安全性。