本发明涉及一种基于微卫星的空间全自动多功能生物反应器，所述生物反应器设有集成了用于肿瘤干细胞更新与增殖的第一液体培养单元、用于肿瘤干细胞耐药研究的第二液体培养单元、用于肿瘤干细胞迁移研究的第一凝胶培养单元和用于干细胞侵袭和诱导血管化研究的第二凝胶培养单元的细胞多功能培养模块。本发明将关于肿瘤干细胞功能研究的实验集成设计在小体积的微型生物反应器中，通过全自动化遥感控制，实现多组实验的无人操作与数据收集。每个液体培养单元都集成设计了各个培养单元的细胞进液通道、培养基进液通道和废液排出通道，可实现空间自动换液。水凝胶三维培养单元统一设计了自动微量加样枪，实现空间自动加样。