本发明公开了一种连续灌流生产的全自动生物反应器，属于生物反应器技术领域，包括反应器，反应器底部接通有第一循环管路，第一循环管路上依次接通有磁悬浮泵与中空纤维过滤器，中空纤维过滤器的输出端接通有第二循环管路，第二循环管路远离中空纤维过滤器的一端与反应器顶端接通，中空纤维过滤器上设有排污口与清洗口，排污口上设有排污件，清洗口上接通有清洗管路，清洗管路朝着清洗口的方向依次接通有水泵、止逆阀、过滤膜与第六隔膜阀，清洗管路上接通有蒸汽管路，蒸汽管路朝着清洗口的方向依次接通有截止阀与减压阀，蒸汽管路位于第六隔膜阀与过滤膜之间，本生物反应器其优点在于，方便清洗中空纤维过滤器，防止造成细胞染菌的风险。