本实用新型公开了一种医疗器械用清洗杀菌装置，涉及医疗设备领域，针对医疗器械在使用过后清洗杀菌会残留清洗剂的问题，现提出如下方案，包括清洗箱，所述清洗箱的顶部箱体外壁焊接有固定杆，所述固定杆的底端通过螺栓连接有电机底座，所述电机底座的顶部通过螺栓连接有驱动电机，所述驱动电机的输出轴固定连接有第一转轴，所述第一转轴贯穿清洗箱的底部箱体，且第一转轴远离驱动电机的一端外圈焊接有搅拌叶，所述搅拌叶的上方设有与第一转轴外圈转动套接的密封盒。本实用新型设计新颖，方便对清洗剂进行混合搅拌，以及对医疗器械进行清洗，清洗后并对其进行烘干，从而使医疗器械清洗后拿出即可再次使用，适合进行市场推广。