本实用新型公开了中小型骨干水源工程运行管理综合信息化系统，其结构包括控制中心，所述控制中心包括物联网I、物联网II、通讯网和互联网，所述通讯网通过电性的方式连接移动终端用户，所述互联网通过电性的方式连RFID，所述物联网I通过导线连接有水闸控制开关、泵站控制开关、视频控制开关和管道控制阀。本实用新型实现了对水源的对地质的情况、水源的质量、降雨量和空气同时进行监测，增加了管理综合信息化系统对水源情况监测时的全面性，而且还能将水源的运行情况发送到移动终端用户上，可以让监督人员第一时间了解小型骨干水源工程运行情况，提高了监督人员对水源运行情况监督时的便捷性。