本实用新型涉及一种黄砂自动取样器，其包括内管和套设在所述内管外侧的外管，所述外管与内管为间隙配合且可相对于内管进行周向转动；所述外管的外侧壁上设置有贯穿其壁厚的外取样孔，所述内管的外侧壁上设置有与外取样孔位置对应的内取样孔；其特征在于：所述外取样孔设置有多个且沿外管的轴向分布，所述内取样孔的数量与外取样孔相等且位置与外取样孔一一对应；所述内管的两端封闭且内管的内部沿其轴向设置有转轴，所述转轴的一端穿过内管的一个端部连接有钻头，所述转轴的另一端穿过内管的另一个端部连接有驱动转轴周向转动的驱动件。本实用新型具有能够快速获取黄砂船内不同深度的黄砂样品的效果，从而对黄砂质量把控的更加准确。