本实用新型公开了一种离位消毒生物反应器的取样装置，包括反应器本体、进气管、排气管、阀门、取样管、软管夹、取样瓶，所述取样瓶的上端开设有与其内部相互连通的取料孔，所述取样管的出料端穿过取料孔延伸至取样瓶内，所述取样瓶的两端内侧壁共同设有导向机构，所述取样管的出料端与导向机构的上端相抵，所述取样瓶上对称设有两个输气机构，所述导向机构的两个自由端均与其相对的输气机构固定连接，两个所述输气机构的上方均开设有卡槽，所述取样瓶上对称设有两个分别延伸至与其相对的卡槽内的限位机构。本实用新型结构设计合理，能够在取样过程中保持反应器本体上的取样管出料端不受污染，进而能够保障检验工作的准确性。