本实用新型公开了一种基于标志物的微生物检测装置，包括装置外壳，所述装置外壳的前表面靠近底部位置固定安装有检测台，所述检测台的上表面开设有放置槽，且检测台的内部开设有固定槽口，所述装置外壳的前表面嵌设有显示屏，且装置外壳的前表面靠近显示屏的外侧位置连接有防护装置，所述防护装置由固定座、透明防护罩、把手、滑轨和滑槽组成，所述检测台的上表面固定安装有支撑柱，所述支撑柱的顶部连接有连接杆，所述连接杆的端头连接有固定柱，所述固定柱的底部连接有升降柱。本实用新型所述的一种基于标志物的微生物检测装置，属于微生物检测技术领域，能够对检测装置的显示屏起到一定的保护作用，且能够对待测物进行不同高度的支撑。