本申请涉及芯片领域，提供一种检测装置、芯片的制造方法及蛋白质类标志物的检测方法用于检测蛋白质类标志物，包括芯片、第一盖板及第二盖板，芯片包括玻璃基体和设置在玻璃基体上的微孔阵列层，微孔阵列层与玻璃基体层叠设置，微孔阵列层包括多个微孔，第一盖板和第二盖板贴合并围成腔体，芯片设置在所腔体中，第一盖板上设置有进液孔和出液孔，进液孔和出液孔设置为通过进液孔进入的液体可以进入腔体，并流经微孔阵列层中的微孔，最终从出液孔排出。应用本申请，采用一具有微孔阵列层的芯片，可以对检测磁珠微粒进行单一分离，实现对蛋白质类标志物的更高精度的检测。