本实用新型涉及医疗设备领域，提供一种医疗废水次氯酸钠消毒及余氯在线监测系统，包括消毒箱，固定盘，转动轮，升降杆，检测机构，显示屏，氯搅拌机构，密封封盖，所述消毒箱的内部上端通过螺栓安装有固定盘，且固定盘的内部嵌入有转动轮，该转动轮的底端通过螺栓连接有升降杆；所述升降杆的底端通过螺纹连接有检测机构；所述检测机构包括检测球壳体，保护层，检测口，单片机，且检测球壳体的外围面上设置有保护层，该检测球壳体的面上设置有检测口，且检测球壳体的内部设置有单片机。本实用新型升降杆，检测机构和氯搅拌机构的设置，检测准确且检测机构使用寿命长，消毒均匀，消毒效果好，便于市场推广和应用。