本实用新型公开了一种畜禽肠道微生物采样装置，包括手柄、装置本体、电池盒和防护门，所述电池盒的外部设置有充电口，所述电池盒外部固定安装有控制面板，且控制面板的内部镶嵌有单片机，所述电池盒的顶部固定安装有手柄，所述电池盒的一端固定安装有装置本体，所述装置本体的外部固定安装有插口，所述装置本体的外部通过螺钉固定安装有合页，且合页的一端通过螺钉固定安装有防护门，所述防护门外部的一端固定安装有安装块，且安装块的内部设置有插销，所述插销的一端设置有拉手，插销的另一端插入到插口的内部，本实用新型通过把试管插入到夹板中，然后夹板就会在弹簧的作用下进行夹持试管实现了对试管进行固定的目的，防止试管掉落。