本发明涉及生物检疫技术领域，且公开了一种活猪肠道内部菌落快速采样装置，包括延伸管，所述延伸管的外部包含有充分采样机构，所述充分采样机构的内部设置有活动板，所述活动板的外部连接有可活动采样刷，所述活动板的外部连接有铰接杆，所述铰接杆的外部连接有转盘，所述活动板的外部滑动连接有定位轨道，所述定位轨道的外部连接有伸入头。该装置具有可灵活自动的调节长度，同时可自动充分的进行采样，防止采样结束后，样品脱落影响实验结果。