本实用新型公开了一种用于磁共振制冷系统的自动切换装置，所述自动切换装置包括冷媒、备用冷媒和控制系统，所述冷媒上设有第一监测装置和第一控制装置，所述备用冷媒上设有第二控制装置，所述第一监测装置与所述控制系统输入端连接，所述控制系统输出端与所述第一控制装置和第二控制装置连接，所述控制系统通过所述第一监测装置实时监测所述冷媒的工作状态，当所述冷媒工作异常时，通过所述第二控制装置启动备用冷媒；该装置在备用管道中加入过滤器，可以防止水造成氦压机内部管道的腐蚀及生锈，同时传感器、变频器与控制系统的配合实用，可以很好地应对冷媒故障，将备用冷媒引入氦压机进行冷却，同时控制水压，避免了水压过大对管道造成损坏。