本实用新型涉及一种磁介质混凝沉淀系统，包括废水调质单元、污泥沉淀单元、磁介质回收单元，废水调质单元包括用于进行废水调质的混凝反应装置，污泥沉淀单元包括用于分离污泥的沉淀装置，磁介质回收单元包括磁泥泵、旋流器及磁回收装置，旋流器的进料口通过第一管道与沉淀装置相连通，磁泥泵设置于第一管道，旋流器的溢流口通过第二管道与磁回收装置相连通，旋流器的沉砂口通过回流管道与混凝反应装置相连通，用于回流磁泥；本磁介质混凝沉淀系统，利用旋流器进行分流，通过仅一台磁泥泵抽取沉淀装置内的磁泥，可以节省一台磁泥泵，且旋流器本身不需要动力，可以节约运行成本，进而可以有效解决现有技术存在的建设和运行成本均偏高等问题。