本实用新型公开了一种智能空气能热水器控制系统，包括单片机、第一温度传感器、液位传感器、第一电磁阀以及第二电磁阀；第一温度传感器安装在水箱中，将水箱中的水温反馈给单片机；单片机在加热超时打开安装在排污口的第一电磁阀排水，并在液位传感器反馈水位已达预设值时关闭第一电磁阀；第二电磁阀和水垢清除剂容纳腔安装在第二进水管上；水垢清除剂容纳腔和第二进水管连通；水垢清除剂随水流进入水箱；单片机在水量达标时关闭第二电磁阀并在延时后打开第一电磁阀排污。通过单片机接收设置在水箱中的第一传感器来测定加热时间，并根据加热时间的变化判断水垢附着情况，单片机在检测到水垢附着较多后自动进行除垢。