本实用新型公开了一种分子泵底盘，涉及真空泵技术领域，包括底盘主体，底盘主体的内部中心设有的电机座，底盘主体的内壁与电机座的外壁之间设为向上方开口的凹槽，电机座的中心设有竖直贯穿底盘主体的通孔，底盘主体的内部设有冷却水管，冷却水管自底盘主体底部一侧向内部延伸并沿着电机座的侧壁内部向上延伸，且沿着电机座顶部的侧壁内部弧形弯曲后向下延伸，并延伸至底盘主体底部一侧；本实用新型集主轴、油池油路、排气口、冷却水、线缆通道等功能结构于一体，结构简单，在满足分子泵各种功能的同时，可以有效减少加工时间，降低零件成本；同时本实用新型通过设置冷却水管预埋件，可深入电机以及上轴承位置进行冷却，有效增强冷却效果。