本实用新型公开了一种弹性密封式水闸门结构，包括固定板，所述固定板的侧面开设有收纳槽，所述收纳槽的内顶壁开设有滑槽，所述滑槽的内壁滑动连接有滑块，所述滑块的下表面固定连接有闸门，所述闸门的侧面开设有凸槽，所述凸槽的内壁活动连接有第一限位盘，所述第一限位盘的侧面固定连接有螺纹杆，所述螺纹杆的一端固定连接有固定盘。该弹性密封式水闸门结构，通过设置固定板、闸门、螺纹杆、直角齿轮、圆杆、第二限位盘、膜片和控制把手，便于通过旋转控制把手，使其带动通过圆杆带动直角齿轮转动，直角齿轮带动螺纹杆转动，螺纹杆转动推动闸门开闭，并通过膜片使圆杆和固定板之间具有密封式弹性，从而达到该水闸门结构具有弹性密封式功能。