本实用新型提供一种太阳能薄膜发电设备的两轮车用后备电源系统，包括外壳，底座，放置架，蓄电池，防护板，散热扇，通气网，电路支板，线盒和开合门，所述外壳的内底部通过螺丝固定有底座，该底座的上部通过该螺丝固定有放置架；所述蓄电池放在放置架上，其中蓄电池的上方为防护板，该防护板安装在外壳的两内侧之间；所述散热扇通过螺栓安装在外壳的内底部，且散热扇的一侧部为蓄电池；所述通气网设在外壳的侧下部，且通气网位于散热扇的另一侧部。本实用新型放置架，防护板，散热扇和通气网的设置，对电池的保护效果较好，使用得到保障，且防潮效果良好，不易受到外界的损坏，实现有效地通风散热，降低工作负荷，满足使用的需要。