本实用新型公开一种密闭式医疗废物微波消毒灭菌仓，包括电机和加料口，所述电机转动端连接有减速机，所述减速机转动端连接有辊轴，其中，所述辊轴表面安装有连接杆，所述微波发射器一侧设置有安装块。该密闭式医疗废物微波消毒灭菌仓，通过微波发射器会向仓体内发出高频电磁波对仓体内的医疗废物进行消毒，该方式在灭菌过程总不会产生有害气体，并且也不会消耗煤炭等不可再生资源，电机通过减速机带动辊轴转动，辊轴转动时会通过连接杆带动搅拌叶转动，搅拌叶会对仓体内的医疗废物进行搅拌，从而使仓体内的医疗废物的灭菌效果更加显著，辊轴与仓体两侧连接处会通过密封卡件构成的密封结构，从而使仓体内部保持密封状态。