一种电磁感应加热结构及其应用消毒烘烤设备，该结构包括电磁感应线圈、支架、耐热分隔层、夹具、发热工件、永磁体层和电磁发生装置，电磁感应线圈设置在支架上，发热工件设置在电磁感应线圈的一侧，且发热工件和电磁感应线圈之间设置有耐热分隔层，发热工件的两端通过夹具与耐热分隔层固定连接，永磁体层设置在电磁感应线圈和电磁发生装置之间且与支架相连接，电磁发生装置设置在永磁体层的另一侧且与电磁感应线圈相连接。利用微晶玻璃将线圈与发热工件分开的形式，使发热工件与电气系统无关联接触，避免了接触漏电的发生；将其应用在烘烤消毒设备中，无需考虑待加热物件的材质，发热工件产生的热量可对任何材质的物件进行加热消毒。