本实用新型提供了一种微生物菌肥发酵设备，属于微生物菌肥生产技术领域，包括外箱、活动设置在所述外箱内部的发酵箱以及带动所述发酵箱进行上下移动的驱动组件，所述发酵箱下方设置有隔板，所述隔板底部设置有底腔，所述发酵箱底部穿设有第二支撑杆，所述第二支撑杆上端固定设置有顶板。本实用新型实施例具有使用方便以及供氧效果好的优点，通过驱动组件带动发酵箱向下移动，使得在第一支撑杆的作用下带动第二支撑杆以及顶板向上移动，利用供气组件向底腔内部注入空气，空气随进气孔第一进气通道、第二进气通道以及第三进气通道注入发酵箱内部，继而沿发酵箱内部菌肥原料的间隙上浮，从而提高氧气与菌肥原料的接触效果，提高发酵质量。