本实用新型公开了一种公共卫生间用自动消毒马桶，涉及公共卫生技术领域，包括马桶基座，所述马桶基座的背面有消毒装置，所述消毒装置的上部固定有储液箱，所述消毒装置的下部固定有消毒箱，所述储液箱通过连接管与消毒箱连通，所述消毒装置的中部有滑杆，所述滑杆的一端伸出通孔，可与马桶盖接触；所述消毒箱的一侧连通有喷淋管，所述喷淋管贯穿消毒装置与马桶基座，可向马桶内喷洒消毒水，所述消毒箱的内部滑动有活塞，所述活塞连接推杆，所述推杆通过密封轴承穿过消毒箱与弹簧连接，所述弹簧的另一端固定在消毒装置的内壁；所述推杆上铰接有铰接杆，且铰接杆的另一端与滑杆相铰接。本实用新型可对马桶内部的细菌进行定期消毒。