本实用新型公开了一种实验容器内腔自动清洗装置，包括支撑框架，其上设置有上开口集水槽，集水槽的开口上密封罩设有透明操作箱；透明操作箱内沿长度方向并排间隔设置有多条供水管，供水管的进水端自透明操作箱的后壁密封穿出，位于透明操作箱内的供水管外壁上间隙套装有与其长度一致的带刷毛清洁支架，透明操作箱的后壁上设置有驱动清洁支架沿供水管轴向转动的防水电机；透明操作箱的左侧壁和右侧壁为铰连于透明操作箱上的侧开门，侧开门的外侧面上设置有把手，与每一供水管相对应的透明操作箱前壁上成对开设有便于手臂穿入的操作孔。本实用新型优点在于结构简单，安全高效，便于操作，保证去除污迹的效果，大大提高工作效率。