本实用新型属于器物清洗技术领域。为解决微藻养殖用玻璃容器在清洗过程中存在的技术问题，本实用新型提供一种柱状微藻养殖设施的清洗装置，包括一垂直设置的硬质供水管，与供水管固定且以供水管为轴心的清洗架，清洗架能够绕供水管自由转动，其特征在于：在供水管的底端设有排水阀，在靠近供水管顶端的管路上设有进水阀；在供水管内部设有虹吸管，所述虹吸管的底端位于排水阀上方，虹吸管的顶端由进水阀下方的供水管管壁伸出，且在该伸出处虹吸管的管壁与供水管的管壁密封连接，在虹吸管的伸出端设有软管接头。本实用新型的有益效果为：清洗完毕后，利用虹吸管将容器内的清洗液自动排出，达到无需人工操作的效果，极大提高了清洗效率。