本实用新型公开了一种多区域温度均衡控制系统，包括加热间室、风机和加热器，所述加热间室与所述热室的壳体之间限定有加热通道，加热间室中限定有加热室、位于加热室下方的降温室和位于所述降温室下方的种植篮室，种植篮室与所述加热通道之间限定有回风口，风机设置在所述回风口处，降温室与所述加热通道之间限定有第一出风口，加热室与所述加热通道之间限定有第二出风口，基于将风机设置在加热间室的下部的设计，采用下部吸风方案，相较于采用上部吸风方案，可以有效解决排水管处冰堵的问题，无需开启温度补偿加热器降低电能耗；根据加热器停机后降温室的温度与预设停机温度来确定下一次加热器启动时的风机的转速，以调整风量大小。