本实用新型公开了一种电芯磁悬浮输送系统。该输送系统包括磁悬浮轨道、倍速链轨道以及电芯托盘；所述电芯托盘在所述磁悬浮轨道可通过磁悬浮驱动滑动移动，而在所述倍速链轨道上可通过倍速链驱动滑动移动；所述磁悬浮轨道与所述倍速链轨道的两端端部之间均设置有电芯托盘单层转移组件。电芯输送时，电芯盛放在电芯托盘上，并采用磁悬浮轨道输送，倍速链轨道用于电芯托盘的回流输送，耗能分配合理；且采用磁悬浮轨道输送电芯，不仅定位精度高，且输送速度快，无抖动、噪音小且无油污等问题，更无摩擦、磨损、掉粉的风险，能极大提高电芯的质量和生产效率。而且，电芯托盘单层转移组件可实现电芯托盘快速高效的回流转移，提高电芯的生产效率。