本实用新型涉及生物医学显微成像技术领域，具体为一种多目立体成像显微镜，包括镜筒，所述镜筒顶部固定设置有安装座，安装座内设与镜筒相配合的圆形通孔，所述安装座的上壁面固定设置多组立柱，所述立柱的顶部固定连接观看板，所述观看板的顶部胶粘有橡胶垫，且观看板与安装座之间设置有若干组扇形挡板，若干组扇形挡板由驱动装置驱动并在安装座上进行直线运动，若干组扇形挡板关于安装座的轴心呈环型阵列分布。通过设置直线往复运动的若干组扇形挡板，能够有效对镜筒地镜筒的镜片进行遮挡和展开，从而有效减少镜筒上粘附灰尘的机率，继而保持良好的观看视线，保障检测结果的准确性。