本发明公开了一种自动判别样品的拉曼光谱仪，包括拉曼光谱仪主体以及连接于所述拉曼光谱仪主体上的检测探头，还包括设置在所述拉曼光谱仪探头两侧的信号发射装置以及信号接收装置；所述信号发射装置发射的信号光朝向所述检测探头的探测方向，并且配置为经由所述检测探头所对应检测的样品反射后，被所述信号接收装置所接收。本实施例在进行拉曼检测之前，先通过信号发射装置和信号接收装置判断检测通道上是否存在样品，在判断有样品的时候才进行后续的拉曼检测，从而避免了因检测通道没有样品而空检测导致的时间耗费。此外，利用红外光电传感器自动检测是否存在样品，相对摄像头，检测时间大大减少，而且对结构空间需求小，安装容易，成本低廉。