本实用新型提出了一种密封性好的集装箱类建筑窄缝柔性密封防水结构，包括填充在相邻两个集装箱之间的密封条，密封条和集装箱上涂刷首层防水涂料后粘贴首层无纺布，之后涂刷次层防水涂料再粘贴次层无纺布，再涂刷第三层防水涂料后再粘贴防水卷材，防水卷材上设置不锈钢扣板。本实用新型通过密封条封堵缝隙，通过两布三油结构提高密封防水效果，不锈钢扣板避免雨水渗透，通过多层防护避免了建筑屋面漏水；且该密封防水结构为柔性结构，避免集装箱热胀冷缩改变缝隙大小而造成漏水；通过将不锈钢扣板设为屋顶型结构，除了将雨水向两侧引流避免雨水渗漏进缝隙，而且屋顶型结构与防水卷材之间形成空腔，对缝隙两侧的屋面具有保温作用。